二代测序平台-上海鲸舟基因科技有限公司

Namocell单细胞分离系统

2018-02-03 19:41:25

Namocell单细胞分离系统采用的是集流式细胞术和微流控技术于一体的新一代细胞分离技术。流式细胞仪的流体聚焦技术能够极大地提高检测灵敏度，另外微流控技术使得设备内部的鞘液压力可以降至2psi以下，也无需高频振荡，极大地减少了分选过程对细胞的伤害，大大提高了分选出来的细胞的活性。另外，一次性芯片真正第一次实现了细胞分选过程中，样本之间的完全隔离（从加样到分离全都在芯片中完成）。工作原理在激光照射的后的微流体通道中，设有电子开关，能够将目的细胞所在液体捕获，并且单个分离出来。样本适用范围所有40微米以下尺寸的悬浮颗粒样本，包括：细胞，酵母，细菌，噬菌体等。系统特点轻柔分选：鞘液压力2psi，提高分选细胞活性灵活分选：样本浓度范围10 ~ 10^8 cell/ml；可挑选百万分之一含量的极稀少样本无菌分选：一次性芯片，保证样本之间完全隔离；仪器体积小巧，可置于超净台中高效分选：96孔板分选不到1min，384孔板4min以内，单克隆率超过95%轻松分选：仪器操作简单，无需专人操作维护应用领域抗体药物开发- 单克隆抗体筛选- 高产细胞株挑选- 高效96孔板单细胞分选单细胞测序- 单细胞分离- 单细胞CTCs（循环肿瘤细胞）捕获- 游离胎儿细胞捕获

10X Genomics Chromium系统

2018-02-09 17:18:13

10x Genomics具有通量高、灵活性强、流程简单、技术性能高、单个细胞制备成本低等优势，其技术核心是油滴包裹的凝胶珠（GEM），该系统有75万种barcoded beads，每个bead上有40-80万探针。技术要点> 8通道的微流体“双十字”交叉系统> 含Barcoded RT Primers的Gel Beads、细胞和酶的混合物、油> 三者结合形成GEMs，即包裹Gel Beads、细胞和酶的混合物的油滴> GEMs被收集（单细胞捕获率≈65%）技术流程>GEM形成后，细胞裂解，凝胶珠自动溶解释放大量barcode序列，随后mRNA逆转录产生带有Barcode和UMI信息的cDNA。 >油滴破碎，cDNA为模板进行PCR扩增，然后进行cDNA打断、加测序接头P5及测序引物R1等传统二代测序的建库过程。 >测序后，得到每个细胞的转录组表达谱，Barcode标记细胞，UMI标记基因并记录表达量。

Illumina MiSeq 测序平台

2018-02-09 17:20:06

簇生成和测序 MiSeq Reagent Kit v2MiSeq Reagent Kit v3读长1 × 36 bp2 × 25 bp2 × 150 bp2 × 250 bp2 × 75 bp2 × 300 bp总时间*~4小时~5.5小时~24 小时~39小时~21小时~56小时产出540–610 Mb750–850 Mb4.5–5.1 Gb7.5–8.5 Gb3.3–3.8 Gb13.2–15 Gb MiSeq Reagent Kit v2 MicroMiSeq Reagent Kit v2 Nano读长2 × 150 bp2 × 250 bp2 × 150 bp总时间*~19小时~28小时~17小时产出1.2 Mb500 Mb300 Mb* 总时间包括MiSeq系统上双表面扫描所实现的簇生成、测序和碱基检出。通过过滤的read** MiSeq Reagent Kit v2MiSeq Reagent Kit v3MiSeq Reagent Kit v2 MicroMiSeq Reagent Kit v2 Nano单端Read12–15 million22–25 million4 million1 million双端Read24–30 million44–50 million8 million2 million** 安装参数是…

Illumina NextSeq 500 测序平台

2018-02-03 16:22:06

NextSeq系列的测序性能参数NextSeq Series High-Output Kit*NextSeq Series Mid-Output Kit*读长总时间†产出读长总时间†产出2 × 150 bp29小时100–120 Gb2 × 150 bp26 hrs32.5–39 Gb2 × 75 bp18小时50–60 Gb2 × 75 bp15 hrs16.25–19.5 Gb1 × 75 bp11小时25–30 Gb*安装参数是基于在所支持的簇密度下运行Illumina PhiX对照文库（通过过滤的簇密度是129-165 K/mm2）所得。根据样本类型、样本质量、通过过滤的簇的不同，真实的性能参数可能有所差异。NextSeq 500的所有试剂盒都适用于双端测序。†总时间包括NextSeq 500系统上双表面扫描所实现的簇生成、测序和碱基检出。通过过滤的read NextSeq Series High-Output KitNextSeq Series Mid-Output Kit单端Read达4亿条达1.3亿条双端Read达8亿条达2.6亿条质量评分††NextSeq Series High-Output KitNextSeq Series Mid-Output Kit在2 x 150 bp时，> 75%的碱基高于Q30在2 x 150 …

Illumina HiSeq X 测序平台

2018-02-03 16:00:04

HiSeq X仪器的性能参数双流动槽单流动槽每次运行的产出1.6-1.8 Tb800-900 Gb通过过滤的read53-60亿条26-30亿条支持的读长2 × 150 bp运行时间不到3天质量评分在2 × 150 bp时，≥ 75%的碱基都高于Q30支持的文库制备TruSeq DNA PCR-Free Library Prep Kit, TruSeq Nano DNA Library Prep Kit* 该参数是基于一台HiSeq X仪器，在所支持的簇密度下运行Illumina PhiX对照文库（1255–1412 K/mm2) 所得。支持的文库制备试剂盒包括TruSeq Nano DNA 和TruSeq DNA PCR-Free，插入片段为350 bp，以及HiSeq X Reagent Kit v2。HiSeq X系统是为全基因组测序而设计、优化并授权的。与其他应用不兼容。HiSeq X系统的测序能力 HiSeq X Ten系统HiSeq X Five系统仪器的最低数量105每年的基因组产出> 18,000> 9000每个30倍基因组的价格< 1000美元< 1500美元

Illumina NovaSeq 6000 测序平台

2018-02-09 17:19:32

每个流动槽的序列产出 NovaSeq 5000与6000系统NovaSeq 6000系统流动槽类型eS1*S2S3*S4*2 x 50 bp高达167 Gb280–333 GbNA**NA**2 × 100 bp高达333 Gb560–667 GbNA**NA**2 × 150 bp高达500 Gb850–1000 Gb高达2000 Gb高达3000 Gb参数基于Illumina PhiX 标准文库支持簇密度下数据产出的情况。* The NovaSeq 5000系统，NovaSeq 5000系统Upgrade以及包含 S1，S3或S4流动槽的NovaSeq Reagent Kits将会在2017年提供。** NA: not applicableReads Passing Filter NovaSeq 5000与6000系统NovaSeq 6000系统流动槽类型S1*S2S3*S4* 高达1.6 B2.8–3.3 B高达6.6 B高达10 B质量分值† 与运行时间†† NovaSeq 6000系统流动槽类型S2Read长度2 x 50 bp2 × 100 bp2 × 150 bp质量分值 (percent of bases above Q30)≥ 85 %≥ 80 %≥ 75 %运行时间19 小时29 小时40…